Altertavlen i bruskbarok er udført af Lorentz Jørgensen o. 1650.

Øverst på topstykket står den sejrende Kristus. På topstykket ses Kristus på korset. Våbenskjold for Jørgen Seefeldt til Vår og Barbra Friis til Kyø. Storfeltet er et nadvermotiv, med Kristus i midten med den discipel, Kristus elskede. Foran bordet sidder Judas med pungen. Foran Kristus står et fad med lammet og ved siden af kalken. Storfeltet flankeres af Moses med lovtavlerne og Johannes Døber med Gudslammet. På fodstykket er der våbenskjold for Tyge Kruse til Åstrup og fru Karen Sehested til Stenhalt.

Tavlen er ubemalet, men ifølge den bemalede indskrift på fodstykket, blev tavlen repareret og stafferet i 1723 på foranledning af Jochum Poulsen og Karen Benzon. Se også prædikestolen i Lundby. Den har altså været bemalet en gang.

Billedsnider Lorentz Jørgensens værker er kendt fra perioden 1644-81. Hans første værker findes på Langeland, men hovedvægten af hans produktion har ligget i Nordvestsjælland. Han havde værksted i Holbæk. Farstrup er det eneste eksempel udenfor øerne. Han er kendt for i alt 29 værker.

Farstrup-tavlen er lidt mindre end Lorentz Jørgensens andre altertavle. Dette må tilskrives kirkens størrelse. Men komposition med valg af motiver har tavlen til fælles med en lang række af hans altertavler.